万州区驻有：重庆三峡学院、重庆三峡职业学院、重庆三峡医药高等专科学校、重庆信息技术职业学院、重庆安全技术职业学院、重庆幼儿师范高等专科学校、重庆科技职业学院。

　　2021年，万州区共有学校436所，其中，普通高等学校7所，普通中等职业学校5所，普通中学65所，小学89所，特殊学校1所，幼儿园269所。共招生9.36万人，其中，普通高等学校招生3.19万人，中等职业学校招生0.76万人。在校学生32.77 万人，其中，普通高等学校在校学生9.69万人，中等职业学校在校学生1.73万人。毕业生数8.06万人，其中，普通高等学校毕业生2.04万人，中等职业学校毕业生0.34万人。高中阶段毛入学率108.2%，初中阶段毛入学率113.6%，小学学龄儿童入学率100.0%。